北京证券交易所（北交所）的核心交易方式是竞价交易，这是其股票交易中最主要和最常见的方式。竞价交易通过交易系统集中撮合买卖订单，遵循价格优先、时间优先的原则，确保市场公平和效率。竞价交易又分为集合竞价和连续竞价两种模式。在每个交易日的开盘和收盘阶段，系统采用集合竞价方式一次性集中撮合订单以产生开盘价和收盘价；而在日间的连续交易时段，则采用连续竞价方式对每一笔新进入的买卖申报进行逐笔、连续的撮合成交，这为投资者提供了实时的交易机会，是市场流动性的主要来源。这种制度设计整体延续了此前新三板精选层的安排，确保了市场运行的稳定性和连续性，也符合大多数投资者的交易习惯。
除了公开的竞价交易，北交所还为满足特定条件的交易提供了大宗交易渠道。大宗交易是一种协议交易方式，主要服务于单笔交易规模较大的投资者，减少大额订单对二级市场价格的直接冲击。根据规则，当单笔申报数量不低于十万股，或者交易金额不低于一百万元人民币时，交易双方可以采用大宗交易方式。大宗交易的申报有特定的时间窗口，成交确认则通常在收盘后进行，其成交价格范围需遵守当日该股票的涨跌幅限制。这种方式为机构投资者或持有大量股份的股东提供了便捷、高效的批量股份转让途径，是竞价交易市场的重要补充。
针对一些特殊的股票转让需求，北交所还规定了协议转让这一交易方式。协议转让主要适用于因收购、股份权益变动、对赌履约或引进战略投资者等特定事项而需要进行股票转让的情形。与在公开市场竞价交易不同，协议转让的买卖双方通过线下协商确定转让价格和数量，并依据北交所的相关规定申请办理。这种方式赋予了交易双方更大的灵活性和私密性，能够满足上市公司在资本运作、股权结构安排等方面的特殊需求，是资本市场多元化功能的重要体现。
北交所也设计了若干特色规则以适配创新型中小企业的特点。其股票交易实行价格涨跌幅限制，除上市首日等特定情况外，涨跌幅限制比例设定为前收盘价的百分之三十，这一比例较主板市场更为宽松，为中小企业提供更充分的价格发现空间。在连续竞价阶段设有申报有效价格范围，以防止订单价格偏离市场基准过大，起到稳定价格的作用。对于上市首日不设涨跌幅限制的股票，北交所还设置了盘中临时停牌机制，当股价波动达到一定幅度时实施临时停牌，以冷却市场过热情绪，提示交易风险。
参与北交所股票交易需要了解其基本的交易单元和结算制度。北交所股票以一百股为一个交易单位，申报时可以一股为单位递增，这降低了投资者的交易门槛，增加了灵活性。在卖出股票时，如果账户中持有的股份余额不足一百股，必须一次性全部申报卖出。在交易结算方面，北交所与沪深交易所一样，实行T+1的交收制度，即当日买入的股票，需要等到下一个交易日才能卖出。这些规则共同构成了北交所市场交易的基础框架。
作为中国主要的证券交易场所之一，北交所的业务核心是为创新型中小企业的股票、债券等标准化证券提供发行与交易服务，其所有交易活动均在严格的金融监管框架下进行。这与去中心化、高波动性的加密货币（币圈）交易存在本质区别。尽管市场存在个别传闻或误解，但北交所官方并未开展亦未涉及任何形式的数字货币或加密货币交易业务。投资者在参与市场时，应清晰辨识不同资产类别的风险属性与监管环境，通过正规券商场内渠道进行北交所股票投资。
